Memoryテーブルを使用したプログラムの統合方法について

いつもお世話になっております。

標題の通り、memoryテーブルを使用したプログラムを「リポジトリ入出力」を行い、プログラムを実ファイルへ出力しました。
出力後、「リポジトリ入力」を行い、プログラムを取り込みました。
取り込んだプログラム内のmemoryテーブルのカラム番号が、統合前と統合後で異なっていました。
上記現象について、解決方法や原因と考えられることなどご教授頂けないでしょうか

よろしくお願い致します。

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補足
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＜実行環境＞
・Windows 7 SP1
・Pervasive V10 WorkGroup
・uniPaaS Studio V1Plus V1 Plus SP1b